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Alla fine sono riuscito a trovare il bandolo della matassa di un problema che mi assillava.
Sul portatile era saltato il Suspend To Ram (S2R) sulla Gentoo
Non sono stato in grado di rintracciare quale update abbia causato il problema perché usando appunto il suspend to ram riavvio il portatile una volta ogni dimissione di papa e nel frattempo aggiorno quello che c’è da aggiornare
Il punto critico credo comunque sia stato il passaggio a >=udev-171

La messa in sospensione continuava a funzionare correttamente, ma il ripristino dalla sospensione causava il boot della macchina invece che il ripristino della sessione sospesa.
Dato che la macchina faceva boot era molto complesso analizzare il problema cercando la soluzione.

Fortunatamente a furia di cercare sono incappato nella soluzione, stavolta stranamente non sui forum Gentoo
A questo link
http://askubuntu.com/questions/24048/suspend-fails-reboot-on-resume-and-no-hibernate-option viene consigliato di aggiungere al boot il parametro 

acpi_sleep=nonvs

Aggiunto il parametro e fatto reboot il Suspend è tornato a funzionare

Giusto per completezza, usando grub2 il parametro va aggiunto in /etc/default/grub alla voce GRUB_CMDLINE_LINUX
Fatto quello bisogna lanciare un

#grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg